hay un programa visual k se llama partition magic k va muy bien para formatear. Tu creas dos discos de inicio arrancas el pc con ellos, despues puedes formatear el pc y tb mirar si hay errores en las particiones, es muy facil de usar.

saludos

PD si kieres un consejo mas, despues de formatear y instalar todo el sistema operativa con sus drivers podrias hacer una imagen de la particion de donde tienes instalado el sistema operativo. Esto consiste en copiar toda la particion en un archivo comprimido y te permitira regenerar el PC en cuestion de 4 mininutos en el caso k tengas un problema con él. Asi no tendras k formatear mas. Un programa para hacerlo es el drive image y otro es el norton ghost, es mas facil de usar el drive image.