He dado con la solución. El problema está en la configuración del WinLirc. En otros hilos había leído los parámetros para los receptores de infrarrojos que vienen con las sintonizadoras de TV. Para el mando de la SS2 es diferente :

Receiver type: "DCD device"
Seleccionar: animax (enable DTR)
Receiver type su "DCD device"

Con estos funciona perfectamente.