Aunque lo de "mejor" siempre es relativo, NTFS es mejor que FAT32. Eso sí, no lo podrás usar desde Win98, y creo que Linux todavía no tiene el driver "fino". Pero si lo quieres sólo para WinXP usa el NTFS sin dudarlo.

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[I]Si tu mejor amigo te clava un puñal en la espalda, debes desconfiar de su amistad[/I]. Proverbio chino, Les Luthiers.