Es que han modificado el gmail notifier

Entra en preferencias ((boton derecho sobre la M) y marca las casillas que en esta version vienen desactivadas por defecto:

En concreto yo he marcado:

Reset counter when the notifier icon is clicked
Only report unread mail in the Inbox

Un saludo

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"Aquel que es cruel con los animales se vuelve tosco en su trato con los hombres. Se puede juzgar el corazón de un hombre por su trato a los animales."
(Inmanuel Kant)