Después de intentarlo casi todo con el Apollo V, pon dll, quita dll, instalar emuladores para montar diferentes Sistemas Operativos, cortarme las venas, etc. he tirado por la calle del medio. Os digo:
* Partition Magic: 1 Partción de 1Gb.
* Instalación de S.O: He puesto el W2000, aunque entiendo que con cualquier otro sin problemas....

...y a correr. Ha funcionado todo a la primera.

Saludos!