Varias cosas:
lo primero es que aunque un canal suela emitir con subtítulos, no todos los programas o pelis que emitan estarán subtitulados. Si es una peli de pigital plus se puede saber consultando la lista mensual en pdf que publican, si dice al final de la sinopsis de la peli VMSUB o VMSUB2 es que tiene subtítulos, VE o VM no tienen.

Segundo, respecto a la técnica, yo pongo el projectx en modo de subtítulos .srt, estos los convierto a .sub con subtitle workshop después de verificar visualmente que están bien (muy raramente tienen fallos, sólo me ha pasado un par de veces en el canal axn). Me parece recordar que .sub directamente desde el projectx también funcionaba.

Los .sub los paso a .sup con dvdsupencode (pregúntale al sr. google). Sup es el formato que admite ifoedit en modo dvdauthor. Creo que projectx también da la opción .sup directamente, pero no lo he probado.