Gracias Kolmo7 ya parece que mi mula ha resucitado, cuento los pasos por si le puede servir a alguien:
- Copio carpeta Incoming y Temp a otro directorio
- Borro todas las carpetas de Emule de mi disco.
- Instalo de nuevo la mula bajada desde el link que me indicaste.
- Desinstalo la mula ( antes no tenia desinstalador )
- Instalo de nuevo v.0.47a
- Copio carpetas Incoming y Temp anteriores a nuevos directorios.
- Arranco y esta se mueve manteniendo las descargas pendientes.