En el directorio donde instalaste el emule hay una carpeta llamada config y dentro tres archivos: known.met, known2.met y known2_64.met que son los que guardan la información de los archivos que conoce tu emule (tanto descargados como que estás descargando).
Cierra el emule, guarda una copia de los tres en otro sitio y luego borras esos archivos de la carpeta. Reinicia otra vez la mula y cuéntanos y así está resuelto tu problema  |