Hola.
Yo tambien he usado ese Live CD en mi Acer Aspire y no me ha pasado nada. Como bien se titula, el Troppix es un Live CD, por lo que no instala nada, por lo que no puede haberte desconfigurado nada, incluso habiéndolo apagado con el comando Halt (tambien utilizado en los mandrake de linux).
A mi me suena o a una casualidad (a mi me ha pasado que he asociado un mal funcionamiento a algun programa y despues resultaba que se había roto algun componente) o que por alguna razon se ha desconfigurado la BIOS (en los PC normales, cuando ni siquiera encienden pulsando el boton de encendido, reseteando la BIOS vuelven a arrancar). Mira en el manual la forma de reseetear la BIOS.
Es lo único que se me ocurre.