No he podido aguantarme y he borrado el ultimo sector -erase:nvram al leerlo antes de borrar salen datos, después ffffffffffffffffffffffff cuando lo arranco borrado me sale lo de PAgE en el display y si lo leo después ya tiene datos, ahora la estoy grabando el nvram que según esta configurado es el ultimo sector de la flash voy por el 26% va muy lento.

Edito para seguir la prueba,
No graba bien, Graba esto:
Erasing block: 35 (addr = 1fdf0000)...Done

Loading NVRAM.BIN to Flash Memory...
[ 0% Flashed] 1fdf0000: 12345678 00000000 03060164 03030303

y lee despues:
Saving NVRAM.BIN.SAVED_20070606_093249 to Disk...
[ 0% Backed Up] 1fdf0000: ff34ff78 ff00ff00 ff06ff64 ff03ff03

Edito por haber hecho mas pruebas,
Me modificado la función para grabar la flash "void sflash_write_word" en modo byte
y este es el resultado:

./wrt54g -flash:nvram /instrlen:5 /skipdetect /alienable
Total Blocks to Erase: 1
Erasing block: 35 (addr = 1fdf0000)...Done

Loading NVRAM.BIN to Flash Memory...
[ 0% Flashed] 1fdf0000: 12345678 00000000 03060164 03030303
[ 0% Flashed] 1fdf0010: 00000000 00000300 00000000 03010000
[ 0% Flashed] 1fdf0020: 01002601 00000003 00000000 00000000

Y leo:
./wrt54g -backup:nvram /instrlen:5 /skipdetect /alienable
=========================
Backup Routine Started
=========================

Saving NVRAM.BIN.SAVED_20070606_100847 to Disk...
[ 0% Backed Up] 1fdf0000: 12345678 00000000 03060164 03030303
[ 0% Backed Up] 1fdf0010: 00000000 00000300 00000000 03010000
[ 0% Backed Up] 1fdf0020: 01002601 00000003 00000000 00000000

O sea que graba correctamente, pero como lo hace en modo byte va más lento.
Ahora ya sabemos que funciona el Jtag para el ali y también como lo hace, a ver si alguién se anima
y mejora la rutina pracc para hacerla más rápida.

Lo empaqueto y lo dejo en el 5 con nombre wrt-ali-graba.zip.

Saludos.