Yo que tú, ponía los 96.000 €.

1. Si hacienda dice que el valor no es ese sino que son 140.000 €, pues te tocaría pagar la diferencia de lo que tenías que haber pagado, más los intereses legales de esa diferencia.
1.1. Yo recurriría, alegando que dada la situación económica, los precios han bajado.
1.2. Puede que pasen 4 años, y no te digan nada.

2. Si pagas sobre 140, no te arriesgas a nada, y quien no se arriesga no gana.

Todo eso sin contar que en la notaria, y el registro de la propiedad, una parte del pago, se realiza sobre el valor de la venta, por lo que también te saldrán más económicos, y en una futura revisión de hacienda, no tienes que volver a pagar notaría ni registro de la propiedad.

Por lo que ha comentado alguien, no tiene sanción el que pagues por 96.000 €, porque lo que tú realizas ante hacienda, es una Autoliquidación, es decir, tú mismo realizas la liquidación, por lo que no estas infringiendo ninguna ley ni normativa.

P.D: Lo mejor es que te informes con algún abogado o asesor que mueva estos papeleos en tu comunidad.