Lo único que se me ocurre es que pongas la base de carga en el centro de las 3 estancias a limpiar, o sea en habitación1-baño, de esa forma sólo tiene que pasar 1 vez por cada faro.

Supongo lo habrás intentado pero por si acaso ¿has intercambiado los faros de sitio? Así podrías distinguir si es problema de un faro concreto (estropeado) o bien de la posición donde tienes el faro 1.

En principio, cada vez que se enciende la roomba busca los faros que tiene a su alrededor para emparentarse con ellos, vamos, que no hace falta ni cambiarle las pilas.