Yaaaaaaaaa se ha arreglado, lo he probado apagando y reiniciando varias veces y ya no me sale la comprobación del sistema

Lo que cambié en el registro autochk /k:C se ha mantenido....

Lo que no hay forma de que se quede en la pantalla es la ventana negra cuando ejecuto [COLOR=Red]fsutil dirty query C:[/COLOR]

Pero bueno, lo principal se ha solucionado, graciassssssssss

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