Las diferencias son mínimas en cuanto a funcionamiento y compatibilidad, pero el HD LOADER está muy mal traducido al español y el HD ADVANCE tiene una traducción correcta.

Básicamente esas es la diferencia, además la versión 2.0 del HD ADVANCE admite HDD de hasta 200 GB, en lugar de los 120 que admite el HD LOADER.

Lo de las particiones no tengo ni idea de si se puede hacer pero aun podiendo ser viable no le veo utilidad ya que si lo que quieres es usarlo en la play y pc has de estar permanentemente conectando y desconectando el HDD de la play al pc y viceversa, además de esta forma ni tendrias mucho espacio para juegos PS2, ni tendrias mucho espacio para programas de PC. Pero como te he dicho no se si se puede, todo es probar!!.

Un saludo!!!